Ein Spezialfall sind auch Messaging-Systeme wie Microsoft Exchange. Werden bei Datenbank-Backups Geschwindigkeiten von bis zu 10 MByte/s erreicht, liegt die Transferrate beim Voll-Backup einer Mailbox nur bei durchschnittlich 3 MByte/s. Aufgrund ihrer besonderen Struktur brauchen Messaging-Systeme genau auf sie zugeschnittene Sicherungstechnologien, die etwa ein mehrfaches Sichern derselben Attachments, Nachrichten oder Kalendereinträge von den Clients verschiedener Mitarbeiter verhindern. Dies würde zu langen Backup-Zeiten und unnötiger Belegung von Speicherplatz führen. Auch Funktionen für die inkrementelle oder differenzielle Sicherung von Mailboxen und öffentlichen Ordnern halten das Backup-Volumen niedrig und beschleunigen das Restore. Gleiches leisten Funktionen, über die sich unternehmensweit bestimmte Daten von der Sicherung auszuschließen lassen.